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生物中心在玉米根虫研究中取得突破进展

生物中心在玉米根虫研究中取得突破进展

核心提示：近日，生物中心青年英才-杨效曾团队和全球顶尖农业公司-科迪华（Corteva Agriscience）-在西部玉米根虫小RNA研究领域取得突破进展。美洲玉米根虫（Diabrotica virgifera virgifera，也称西部玉米根虫）是北美最具破坏性的农业害虫之一，每年带来的损失以10亿美元为单位计算。

近日，生物中心青年英才-杨效曾团队和全球顶尖农业公司-科迪华（Corteva Agriscience）-大节竹属在西部玉米根虫小RNA研究领域取得突破进展。美洲玉米根虫（Diabrotica virgifera virgifera，也称西部玉米根虫）是北美最具破坏性的农业害虫之一，每年带来的损失以10亿美元为单位计算。这项合作系统鉴定和研究了玉米根虫中小RNA在不同发育阶段的动态变化情况，揭示了玉米根虫和常见昆虫中miRNA簇的选择和进化，为研究西部玉米根虫和其它鞘翅目昆虫中小RNA转录组和miRNA介导的基因调控提供了新的认识。相关的论文发表在卓越期刊GENOMICS PROTEOMICS BIOINFORMATICS 上（中科院分区1区，影响因子7.051），生物中心为第一通讯单位。

该工作利用小RNA测序的方法，在玉米根虫中鉴定到了101个保守的miRNA基因和277个玉米根虫特异的miRNA基因。进一步研究发现与所有物种中miRNA首个碱基一样，U具有明显的偏好性，即使是西部玉米根虫和北部玉米根虫，两墨脱瓦韦个相近的物种中，miRNA也出现了很多分化（variations）。

图1、部分玉米根虫miRNA的特点

该研究还发现有超过20个miRNA家族在节肢动物中高度保守，并且在不同的进化分支中，都有一些该节点特异的miRNA，该工作揭示了大量（超过200个）的玉米根虫特异的miRNA，大部分这些miRNA的表达量都比较低，说明其正在接受miRNA及靶基因调控机制的筛选，而部分高表野灯心草达的特异的miRNA已经在调控络中固定了下来。

图2、西部玉米根虫及北部玉米根虫中miRNA与其它物种miRNA保守性分析

该工作另一个比较有意思的发现是对节肢动物中一些高度保守的miRNA簇的进化及表达分析，尽管在成员分布和顺序上有差异，这些保守的miRNA簇在不同的物种中呈现出很好的保守性。另外通过表达分析，发现簇中的不同成员在不同的组织中具有很相似的表达模式，说明他们之间的功能具每一年的邻近纯洁国产矿市场价格部份地区上涨有很强的联系。

图3、不同物种中miR-2和miR-13组成基因簇的进化模式

该研究受到了来自科迪华公司小RNA重点项目和我院青年英才引进启动经费的支持。青年英才杨效曾团队关注植物miRNA和作物育种研究，课题组常年招生生物信息学和分子生物学方向的博士后，更多详细的信息见例如 ldquo;马赛克式 rdquo;拼板生产课题组站（），有兴趣加入实验室的请发简历至yangxia隐柱昙花ozeng@或yangxz@.